Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCR4P51679 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCR4P51679 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCR4P51679 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCR4P51679 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCR4P51679 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCR4P51679 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCR4P51679 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCR4P51679 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCR4P51679 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCR4P51679 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCR4P51679 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCR4P51679 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCR4P51679 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCR4P51679 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCR4P51679 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCR4P51679 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCR4P51679 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCR4P51679 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCR4P51679 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCR4P51679 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCR4P51679 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCR4P51679 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCR4P51679 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCR4P51679 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCR4P51679 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCR4P51679 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCR4P51679 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCR4P51679 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCR4P51679 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCR4P51679 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCR4P51679 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCR4P51679 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCR4P51679 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCR4P51679 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCR4P51679 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCR4P51679 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCR4P51679 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCR4P51679 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCR4P51679 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCR4P51679 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms