Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERFP50548 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERFP50548 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERFP50548 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERFP50548 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERFP50548 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERFP50548 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERFP50548 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERFP50548 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERFP50548 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERFP50548 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERFP50548 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERFP50548 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERFP50548 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERFP50548 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERFP50548 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERFP50548 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERFP50548 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERFP50548 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERFP50548 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERFP50548 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERFP50548 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERFP50548 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERFP50548 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERFP50548 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERFP50548 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERFP50548 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERFP50548 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERFP50548 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERFP50548 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERFP50548 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERFP50548 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERFP50548 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERFP50548 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERFP50548 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERFP50548 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERFP50548 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms