Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTPAP49638 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTPAP49638 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTPAP49638 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TTPAP49638 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTPAP49638 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTPAP49638 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTPAP49638 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTPAP49638 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTPAP49638 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTPAP49638 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTPAP49638 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTPAP49638 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTPAP49638 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTPAP49638 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTPAP49638 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTPAP49638 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTPAP49638 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTPAP49638 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTPAP49638 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTPAP49638 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTPAP49638 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTPAP49638 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTPAP49638 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTPAP49638 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTPAP49638 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTPAP49638 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTPAP49638 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTPAP49638 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTPAP49638 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTPAP49638 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTPAP49638 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTPAP49638 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTPAP49638 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTPAP49638 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTPAP49638 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTPAP49638 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTPAP49638 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTPAP49638 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTPAP49638 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTPAP49638 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTPAP49638 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTPAP49638 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTPAP49638 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TTPAP49638 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTPAP49638 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTPAP49638 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTPAP49638 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTPAP49638 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTPAP49638 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTPAP49638 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTPAP49638 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTPAP49638 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTPAP49638 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTPAP49638 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTPAP49638 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTPAP49638 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTPAP49638 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTPAP49638 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTPAP49638 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTPAP49638 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTPAP49638 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTPAP49638 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTPAP49638 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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