Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PIP4K2AP48426 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PIP4K2AP48426 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PIP4K2AP48426 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms