Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GALR1P47211 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALR1P47211 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALR1P47211 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALR1P47211 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALR1P47211 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GALR1P47211 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GALR1P47211 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GALR1P47211 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GALR1P47211 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GALR1P47211 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GALR1P47211 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GALR1P47211 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GALR1P47211 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GALR1P47211 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GALR1P47211 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GALR1P47211 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GALR1P47211 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GALR1P47211 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GALR1P47211 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GALR1P47211 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GALR1P47211 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GALR1P47211 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GALR1P47211 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GALR1P47211 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GALR1P47211 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GALR1P47211 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms