Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL21P46778 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL21P46778 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL21P46778 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL21P46778 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL21P46778 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL21P46778 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL21P46778 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL21P46778 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL21P46778 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL21P46778 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL21P46778 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL21P46778 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL21P46778 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL21P46778 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL21P46778 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL21P46778 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL21P46778 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL21P46778 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL21P46778 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL21P46778 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL21P46778 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL21P46778 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL21P46778 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL21P46778 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL21P46778 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL21P46778 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL21P46778 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL21P46778 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL21P46778 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL21P46778 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL21P46778 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL21P46778 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL21P46778 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL21P46778 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL21P46778 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL21P46778 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL21P46778 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL21P46778 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL21P46778 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL21P46778 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL21P46778 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL21P46778 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL21P46778 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL21P46778 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL21P46778 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL21P46778 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms