Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGER3P43115 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER3P43115 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER3P43115 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms