Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A4P43007 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC1A4P43007 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A4P43007 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms