Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA1P42261 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA1P42261 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA1P42261 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 696.9 ms