Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MDH1P40925 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MDH1P40925 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH1P40925 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH1P40925 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH1P40925 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH1P40925 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH1P40925 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH1P40925 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH1P40925 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH1P40925 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDH1P40925 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDH1P40925 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH1P40925 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH1P40925 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH1P40925 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH1P40925 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH1P40925 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH1P40925 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDH1P40925 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDH1P40925 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MDH1P40925 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MDH1P40925 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDH1P40925 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDH1P40925 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDH1P40925 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDH1P40925 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDH1P40925 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDH1P40925 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDH1P40925 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDH1P40925 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDH1P40925 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH1P40925 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH1P40925 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH1P40925 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH1P40925 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH1P40925 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MDH1P40925 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH1P40925 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH1P40925 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH1P40925 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MDH1P40925 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms