Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX2P40425 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX2P40425 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PBX2P40425 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PBX2P40425 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PBX2P40425 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX2P40425 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX2P40425 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX2P40425 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX2P40425 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX2P40425 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX2P40425 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX2P40425 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PBX2P40425 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX2P40425 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX2P40425 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX2P40425 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX2P40425 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX2P40425 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX2P40425 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PBX2P40425 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX2P40425 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX2P40425 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX2P40425 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX2P40425 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX2P40425 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PBX2P40425 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX2P40425 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX2P40425 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX2P40425 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PBX2P40425 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX2P40425 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX2P40425 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX2P40425 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX2P40425 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PBX2P40425 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX2P40425 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX2P40425 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX2P40425 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX2P40425 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX2P40425 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX2P40425 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX2P40425 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PBX2P40425 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX2P40425 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX2P40425 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX2P40425 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX2P40425 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX2P40425 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PBX2P40425 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PBX2P40425 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PBX2P40425 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX2P40425 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX2P40425 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX2P40425 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX2P40425 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX2P40425 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PBX2P40425 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX2P40425 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PBX2P40425 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms