Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CAPGP40121 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAPGP40121 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPGP40121 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPGP40121 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPGP40121 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPGP40121 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPGP40121 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPGP40121 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPGP40121 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPGP40121 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPGP40121 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPGP40121 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPGP40121 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPGP40121 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPGP40121 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPGP40121 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPGP40121 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPGP40121 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPGP40121 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPGP40121 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPGP40121 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPGP40121 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPGP40121 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPGP40121 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPGP40121 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CAPGP40121 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms