Protein–RNA interactions for Protein: P38255

RXT2, Transcriptional regulatory protein RXT2, yeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RXT2	P38255	ATE1	YGL017W	1512 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	IWR1	YDL115C	1062 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	CWC21	YDR482C	408 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	RPB4	YJL140W	666 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	FUN19	YAL034C	1242 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	SPG4	YMR107W	348 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	YNL296W	YNL296W	315 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	CUE2	YKL090W	1332 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	ATR1	YML116W	1629 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	VTC2	YFL004W	2487 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	SAP155	YFR040W	3009 nt		5.66	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	WTM2	YOR229W	1404 nt		5.65	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	PDI1	YCL043C	1569 nt		5.65	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	HMLALPHA1	YCL066W	528 nt		5.65	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	MATALPHA1	YCR040W	528 nt		5.65	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	PHO86	YJL117W	936 nt		5.65	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	YNL019C	YNL019C	855 nt		5.65	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	YNL033W	YNL033W	855 nt		5.65	□□□□□ -1.5
RXT2	P38255	YIR007W	YIR007W	2295 nt		5.65	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	RPT2	YDL007W	1314 nt		5.65	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	RTT103	YDR289C	1230 nt		5.64	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	RML2	YEL050C	1182 nt		5.64	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	NSG1	YHR133C	876 nt		5.64	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	YLR346C	YLR346C	306 nt		5.64	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	MTF1	YMR228W	1026 nt		5.64	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	MRI1	YPR118W	1236 nt		5.64	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	MNN2	YBR015C	1794 nt		5.64	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	MBP1	YDL056W	2502 nt		5.64	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	FAA4	YMR246W	2085 nt		5.63	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	SIS2	YKR072C	1689 nt		5.63	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	SUM1	YDR310C	3189 nt		5.63	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	MF(ALPHA)2	YGL089C	363 nt		5.63	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	RFA2	YNL312W	822 nt		5.63	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	CAM1	YPL048W	1248 nt		5.63	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	TUB2	YFL037W	1374 nt		5.63	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	ASF2	YDL197C	1578 nt		5.63	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	FRE7	YOL152W	1863 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	HPC2	YBR215W	1878 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	GTO1	YGR154C	1071 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	PUS6	YGR169C	1215 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	COS6	YGR295C	1146 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	CTR3	YLR411W	726 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	VHS2	YIL135C	1311 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	BIT2	YBR270C	1638 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	LCB2	YDR062W	1686 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	ARN1	YHL040C	1884 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	SEC39	YLR440C	2130 nt		5.62	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	SLT2	YHR030C	1455 nt		5.61	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	PSE1	YMR308C	3270 nt		5.61	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	YNL095C	YNL095C	1929 nt		5.61	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	SPS18	YNL204C	903 nt		5.61	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	GDB1	YPR184W	4611 nt		5.61	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	CDS1	YBR029C	1374 nt		5.6	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	GLE2	YER107C	1098 nt		5.6	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	THI5	YFL058W	1023 nt		5.6	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	YGL185C	YGL185C	1140 nt		5.6	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	MRPL4	YLR439W	960 nt		5.6	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	THI12	YNL332W	1023 nt		5.6	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	CKB2	YOR039W	777 nt		5.6	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	ETT1	YOR051C	1239 nt		5.6	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	NRD1	YNL251C	1728 nt		5.6	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	BRE2	YLR015W	1518 nt		5.59	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	CLB4	YLR210W	1383 nt		5.59	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	HES1	YOR237W	1305 nt		5.59	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	UBP7	YIL156W	3216 nt		5.59	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	YCR075W-A	YCR075W-A	228 nt		5.59	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	HST4	YDR191W	1113 nt		5.59	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	YGR122W	YGR122W	1209 nt		5.59	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	YAL044W-A	YAL044W-A	333 nt		5.59	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	HXT4	YHR092C	1731 nt		5.59	□□□□□ -1.51
RXT2	P38255	FPK1	YNR047W	2682 nt		5.59	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	KRS1	YDR037W	1776 nt		5.58	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	COT1	YOR316C	1320 nt		5.58	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	CSM2	YIL132C	642 nt		5.58	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	YJR085C	YJR085C	318 nt		5.58	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	MAL11	YGR289C	1851 nt		5.58	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	IMA1	YGR287C	1770 nt		5.57	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	ADE3	YGR204W	2841 nt		5.57	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	HXT14	YNL318C	1623 nt		5.57	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		5.57	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	TAF11	YML015C	1041 nt		5.57	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	YML057C-A	YML057C-A	390 nt		5.57	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	PCL8	YPL219W	1479 nt		5.57	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	SER33	YIL074C	1410 nt		5.57	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	MCX1	YBR227C	1563 nt		5.56	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	STE20	YHL007C	2820 nt		5.56	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	RRT7	YLL030C	342 nt		5.56	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	CUE5	YOR042W	1236 nt		5.56	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	SMA1	YPL027W	738 nt		5.56	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	PXA1	YPL147W	2613 nt		5.56	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	CYK3	YDL117W	2658 nt		5.55	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	DRN1	YGR093W	1524 nt		5.55	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	YNG2	YHR090C	849 nt		5.55	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	SKG1	YKR100C	1068 nt		5.55	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	HEM15	YOR176W	1182 nt		5.55	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	SDA1	YGR245C	2304 nt		5.55	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	UGA2	YBR006W	1494 nt		5.55	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	SLD2	YKL108W	1362 nt		5.55	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	MMT2	YPL224C	1455 nt		5.54	□□□□□ -1.52
RXT2	P38255	TRS23	YDR246W	660 nt		5.54	□□□□□ -1.52

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms