Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRT9P35527 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT9P35527 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT9P35527 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT9P35527 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRT9P35527 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT9P35527 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT9P35527 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT9P35527 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT9P35527 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT9P35527 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT9P35527 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT9P35527 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT9P35527 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT9P35527 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT9P35527 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT9P35527 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT9P35527 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT9P35527 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT9P35527 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT9P35527 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT9P35527 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT9P35527 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT9P35527 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT9P35527 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT9P35527 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT9P35527 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT9P35527 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT9P35527 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT9P35527 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT9P35527 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT9P35527 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms