Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GPC1P35052 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GPC1P35052 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC1P35052 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC1P35052 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC1P35052 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC1P35052 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC1P35052 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GPC1P35052 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC1P35052 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC1P35052 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC1P35052 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC1P35052 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC1P35052 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC1P35052 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC1P35052 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GPC1P35052 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GPC1P35052 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GPC1P35052 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GPC1P35052 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC1P35052 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC1P35052 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC1P35052 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC1P35052 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC1P35052 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC1P35052 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPC1P35052 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC1P35052 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC1P35052 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC1P35052 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC1P35052 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC1P35052 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC1P35052 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC1P35052 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC1P35052 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC1P35052 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC1P35052 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms