Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSP1P33241 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSP1P33241 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSP1P33241 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSP1P33241 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSP1P33241 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSP1P33241 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSP1P33241 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSP1P33241 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSP1P33241 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSP1P33241 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSP1P33241 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LSP1P33241 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSP1P33241 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSP1P33241 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSP1P33241 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSP1P33241 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSP1P33241 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSP1P33241 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSP1P33241 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSP1P33241 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSP1P33241 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSP1P33241 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSP1P33241 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSP1P33241 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSP1P33241 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSP1P33241 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSP1P33241 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSP1P33241 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSP1P33241 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSP1P33241 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSP1P33241 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSP1P33241 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSP1P33241 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSP1P33241 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSP1P33241 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSP1P33241 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSP1P33241 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSP1P33241 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSP1P33241 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSP1P33241 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSP1P33241 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSP1P33241 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSP1P33241 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSP1P33241 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSP1P33241 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSP1P33241 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSP1P33241 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LSP1P33241 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms