Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNA3P32297 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA3P32297 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA3P32297 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms