Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA13P31271 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA13P31271 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA13P31271 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms