Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRIP30626 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRIP30626 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRIP30626 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRIP30626 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRIP30626 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRIP30626 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRIP30626 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRIP30626 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRIP30626 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRIP30626 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRIP30626 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRIP30626 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRIP30626 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRIP30626 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRIP30626 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms