Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TM4SF1P30408 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TM4SF1P30408 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TM4SF1P30408 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TM4SF1P30408 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms