Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND3P30281 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND3P30281 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND3P30281 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCND3P30281 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCND3P30281 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCND3P30281 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCND3P30281 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCND3P30281 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND3P30281 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND3P30281 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCND3P30281 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND3P30281 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND3P30281 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND3P30281 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND3P30281 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND3P30281 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND3P30281 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND3P30281 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCND3P30281 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND3P30281 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND3P30281 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND3P30281 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCND3P30281 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCND3P30281 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND3P30281 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND3P30281 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND3P30281 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND3P30281 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND3P30281 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND3P30281 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND3P30281 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCND3P30281 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND3P30281 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND3P30281 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND3P30281 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND3P30281 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND3P30281 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCND3P30281 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCND3P30281 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND3P30281 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND3P30281 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND3P30281 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND3P30281 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND3P30281 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND3P30281 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND3P30281 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCND3P30281 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND3P30281 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND3P30281 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND3P30281 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND3P30281 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCND3P30281 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCND3P30281 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCND3P30281 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND3P30281 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND3P30281 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND3P30281 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND3P30281 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND3P30281 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND3P30281 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND3P30281 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND3P30281 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCND3P30281 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND3P30281 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCND3P30281 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms