Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID4AP29374 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARID4AP29374 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID4AP29374 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms