Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRB3P28472 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRB3P28472 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRB3P28472 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms