Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR1BP28222 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTR1BP28222 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTR1BP28222 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms