Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PSMB9P28065 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PSMB9P28065 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.3 ms