Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNTFP26441 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTFP26441 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTFP26441 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTFP26441 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTFP26441 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTFP26441 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTFP26441 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTFP26441 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTFP26441 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTFP26441 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTFP26441 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTFP26441 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTFP26441 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTFP26441 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTFP26441 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTFP26441 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTFP26441 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTFP26441 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTFP26441 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTFP26441 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTFP26441 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTFP26441 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTFP26441 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTFP26441 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTFP26441 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTFP26441 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTFP26441 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms