Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR2AP24928 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms