Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDELR1P24390 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KDELR1P24390 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms