Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYF6P23409 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYF6P23409 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYF6P23409 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYF6P23409 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYF6P23409 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYF6P23409 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYF6P23409 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYF6P23409 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MYF6P23409 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MYF6P23409 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYF6P23409 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYF6P23409 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MYF6P23409 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MYF6P23409 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYF6P23409 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYF6P23409 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYF6P23409 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MYF6P23409 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MYF6P23409 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MYF6P23409 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYF6P23409 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYF6P23409 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYF6P23409 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYF6P23409 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYF6P23409 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYF6P23409 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MYF6P23409 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYF6P23409 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MYF6P23409 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MYF6P23409 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYF6P23409 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYF6P23409 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYF6P23409 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MYF6P23409 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYF6P23409 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYF6P23409 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYF6P23409 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYF6P23409 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYF6P23409 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYF6P23409 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYF6P23409 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MYF6P23409 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MYF6P23409 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYF6P23409 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYF6P23409 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYF6P23409 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYF6P23409 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MYF6P23409 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYF6P23409 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYF6P23409 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYF6P23409 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYF6P23409 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYF6P23409 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYF6P23409 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYF6P23409 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MYF6P23409 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms