Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GLDCP23378 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLDCP23378 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLDCP23378 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLDCP23378 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLDCP23378 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLDCP23378 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GLDCP23378 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLDCP23378 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GLDCP23378 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLDCP23378 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GLDCP23378 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLDCP23378 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLDCP23378 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GLDCP23378 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GLDCP23378 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GLDCP23378 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GLDCP23378 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLDCP23378 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GLDCP23378 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLDCP23378 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GLDCP23378 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLDCP23378 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLDCP23378 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLDCP23378 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLDCP23378 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GLDCP23378 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GLDCP23378 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLDCP23378 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLDCP23378 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLDCP23378 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLDCP23378 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLDCP23378 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLDCP23378 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLDCP23378 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLDCP23378 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GLDCP23378 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GLDCP23378 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GLDCP23378 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms