Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ME2P23368 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME2P23368 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME2P23368 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME2P23368 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME2P23368 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME2P23368 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ME2P23368 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME2P23368 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ME2P23368 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ME2P23368 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ME2P23368 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME2P23368 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME2P23368 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME2P23368 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME2P23368 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME2P23368 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME2P23368 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ME2P23368 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME2P23368 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME2P23368 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME2P23368 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME2P23368 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME2P23368 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME2P23368 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME2P23368 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME2P23368 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME2P23368 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME2P23368 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME2P23368 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME2P23368 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ME2P23368 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME2P23368 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ME2P23368 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms