Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB2P22676 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB2P22676 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB2P22676 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB2P22676 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALB2P22676 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB2P22676 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB2P22676 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB2P22676 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB2P22676 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB2P22676 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALB2P22676 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALB2P22676 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB2P22676 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB2P22676 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB2P22676 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB2P22676 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB2P22676 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALB2P22676 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALB2P22676 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALB2P22676 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALB2P22676 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CALB2P22676 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB2P22676 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB2P22676 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB2P22676 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB2P22676 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB2P22676 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CALB2P22676 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB2P22676 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB2P22676 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB2P22676 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB2P22676 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB2P22676 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB2P22676 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB2P22676 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB2P22676 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CALB2P22676 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB2P22676 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB2P22676 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB2P22676 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB2P22676 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB2P22676 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB2P22676 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CALB2P22676 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CALB2P22676 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB2P22676 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB2P22676 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB2P22676 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB2P22676 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB2P22676 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CALB2P22676 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB2P22676 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB2P22676 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB2P22676 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB2P22676 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CALB2P22676 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CALB2P22676 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms