Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ACO1P21399 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACO1P21399 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACO1P21399 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACO1P21399 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACO1P21399 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACO1P21399 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACO1P21399 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACO1P21399 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ACO1P21399 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACO1P21399 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACO1P21399 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACO1P21399 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACO1P21399 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACO1P21399 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ACO1P21399 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACO1P21399 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACO1P21399 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACO1P21399 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACO1P21399 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACO1P21399 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACO1P21399 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACO1P21399 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ACO1P21399 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACO1P21399 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACO1P21399 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACO1P21399 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ACO1P21399 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ACO1P21399 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACO1P21399 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACO1P21399 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACO1P21399 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ACO1P21399 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACO1P21399 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACO1P21399 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACO1P21399 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACO1P21399 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACO1P21399 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACO1P21399 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACO1P21399 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACO1P21399 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACO1P21399 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACO1P21399 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACO1P21399 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACO1P21399 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACO1P21399 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACO1P21399 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACO1P21399 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACO1P21399 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACO1P21399 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACO1P21399 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACO1P21399 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACO1P21399 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACO1P21399 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACO1P21399 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACO1P21399 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACO1P21399 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACO1P21399 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ACO1P21399 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACO1P21399 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACO1P21399 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACO1P21399 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACO1P21399 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACO1P21399 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACO1P21399 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACO1P21399 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACO1P21399 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACO1P21399 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACO1P21399 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACO1P21399 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACO1P21399 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACO1P21399 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACO1P21399 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACO1P21399 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACO1P21399 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACO1P21399 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACO1P21399 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACO1P21399 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACO1P21399 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACO1P21399 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACO1P21399 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACO1P21399 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACO1P21399 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACO1P21399 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACO1P21399 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACO1P21399 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACO1P21399 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms