Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NTF3P20783 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTF3P20783 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTF3P20783 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTF3P20783 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTF3P20783 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTF3P20783 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NTF3P20783 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTF3P20783 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NTF3P20783 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTF3P20783 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTF3P20783 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTF3P20783 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTF3P20783 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTF3P20783 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NTF3P20783 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NTF3P20783 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NTF3P20783 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NTF3P20783 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NTF3P20783 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NTF3P20783 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTF3P20783 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTF3P20783 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTF3P20783 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTF3P20783 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTF3P20783 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTF3P20783 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NTF3P20783 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms