Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFEBP19484 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFEBP19484 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFEBP19484 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFEBP19484 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFEBP19484 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFEBP19484 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFEBP19484 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFEBP19484 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFEBP19484 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFEBP19484 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFEBP19484 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFEBP19484 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFEBP19484 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFEBP19484 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFEBP19484 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFEBP19484 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFEBP19484 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFEBP19484 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFEBP19484 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFEBP19484 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFEBP19484 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFEBP19484 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFEBP19484 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFEBP19484 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFEBP19484 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFEBP19484 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFEBP19484 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFEBP19484 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFEBP19484 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFEBP19484 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFEBP19484 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFEBP19484 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TFEBP19484 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFEBP19484 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFEBP19484 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFEBP19484 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFEBP19484 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFEBP19484 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFEBP19484 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TFEBP19484 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFEBP19484 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFEBP19484 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TFEBP19484 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFEBP19484 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFEBP19484 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFEBP19484 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFEBP19484 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFEBP19484 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFEBP19484 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFEBP19484 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFEBP19484 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFEBP19484 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFEBP19484 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFEBP19484 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFEBP19484 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFEBP19484 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFEBP19484 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms