Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD53P19397 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD53P19397 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD53P19397 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD53P19397 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD53P19397 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD53P19397 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD53P19397 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD53P19397 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CD53P19397 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CD53P19397 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CD53P19397 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CD53P19397 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD53P19397 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CD53P19397 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CD53P19397 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD53P19397 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CD53P19397 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD53P19397 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD53P19397 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD53P19397 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD53P19397 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CD53P19397 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CD53P19397 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD53P19397 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD53P19397 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD53P19397 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD53P19397 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CD53P19397 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD53P19397 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD53P19397 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD53P19397 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD53P19397 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD53P19397 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD53P19397 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CD53P19397 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CD53P19397 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD53P19397 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD53P19397 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CD53P19397 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms