Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VCAM1P19320 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VCAM1P19320 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VCAM1P19320 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms