Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNI1P19237 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNI1P19237 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms