Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL17P18621 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17P18621 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17P18621 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17P18621 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17P18621 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL17P18621 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL17P18621 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17P18621 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17P18621 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17P18621 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17P18621 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17P18621 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17P18621 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17P18621 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL17P18621 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17P18621 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17P18621 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL17P18621 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17P18621 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17P18621 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17P18621 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17P18621 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17P18621 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL17P18621 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL17P18621 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL17P18621 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL17P18621 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL17P18621 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL17P18621 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL17P18621 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL17P18621 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL17P18621 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms