Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGB6P18564 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGB6P18564 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGB6P18564 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms