Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LBPP18428 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LBPP18428 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBPP18428 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBPP18428 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBPP18428 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBPP18428 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBPP18428 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LBPP18428 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LBPP18428 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LBPP18428 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBPP18428 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBPP18428 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBPP18428 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBPP18428 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBPP18428 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LBPP18428 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBPP18428 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LBPP18428 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBPP18428 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBPP18428 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBPP18428 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBPP18428 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LBPP18428 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBPP18428 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBPP18428 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LBPP18428 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBPP18428 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBPP18428 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LBPP18428 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBPP18428 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LBPP18428 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LBPP18428 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBPP18428 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBPP18428 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBPP18428 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBPP18428 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBPP18428 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBPP18428 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBPP18428 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LBPP18428 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LBPP18428 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBPP18428 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms