Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN1P18031 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN1P18031 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN1P18031 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms