Protein–RNA interactions for Protein: P17693

HLA-G, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain G, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-GP17693 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-GP17693 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-GP17693 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-GP17693 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-GP17693 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HLA-GP17693 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HLA-GP17693 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HLA-GP17693 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms