Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXB6P17509 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB6P17509 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXB6P17509 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB6P17509 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB6P17509 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB6P17509 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB6P17509 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB6P17509 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB6P17509 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB6P17509 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXB6P17509 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB6P17509 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB6P17509 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB6P17509 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB6P17509 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB6P17509 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB6P17509 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB6P17509 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB6P17509 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB6P17509 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB6P17509 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB6P17509 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB6P17509 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms