Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB8P17481 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB8P17481 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms