Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA1P15085 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA1P15085 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA1P15085 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPA1P15085 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA1P15085 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA1P15085 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA1P15085 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA1P15085 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPA1P15085 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA1P15085 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA1P15085 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA1P15085 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA1P15085 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA1P15085 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA1P15085 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPA1P15085 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPA1P15085 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA1P15085 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA1P15085 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA1P15085 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA1P15085 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA1P15085 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPA1P15085 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPA1P15085 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA1P15085 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA1P15085 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA1P15085 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA1P15085 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA1P15085 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPA1P15085 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CPA1P15085 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CPA1P15085 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA1P15085 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA1P15085 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA1P15085 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA1P15085 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA1P15085 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA1P15085 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA1P15085 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA1P15085 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPA1P15085 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA1P15085 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA1P15085 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA1P15085 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CPA1P15085 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA1P15085 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA1P15085 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA1P15085 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA1P15085 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA1P15085 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA1P15085 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA1P15085 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CPA1P15085 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA1P15085 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA1P15085 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA1P15085 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA1P15085 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA1P15085 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA1P15085 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CPA1P15085 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CPA1P15085 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA1P15085 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA1P15085 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA1P15085 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA1P15085 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CPA1P15085 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA1P15085 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA1P15085 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA1P15085 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA1P15085 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA1P15085 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CPA1P15085 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms