Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCSHP14314 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCSHP14314 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCSHP14314 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCSHP14314 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCSHP14314 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCSHP14314 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCSHP14314 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKCSHP14314 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRKCSHP14314 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKCSHP14314 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCSHP14314 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCSHP14314 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKCSHP14314 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms