Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TDGF1P13385 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TDGF1P13385 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TDGF1P13385 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms