Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GP1BBP13224 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GP1BBP13224 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GP1BBP13224 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GP1BBP13224 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GP1BBP13224 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GP1BBP13224 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GP1BBP13224 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GP1BBP13224 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GP1BBP13224 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GP1BBP13224 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GP1BBP13224 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GP1BBP13224 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GP1BBP13224 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GP1BBP13224 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GP1BBP13224 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GP1BBP13224 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GP1BBP13224 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GP1BBP13224 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GP1BBP13224 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GP1BBP13224 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GP1BBP13224 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GP1BBP13224 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GP1BBP13224 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GP1BBP13224 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GP1BBP13224 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GP1BBP13224 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GP1BBP13224 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GP1BBP13224 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GP1BBP13224 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GP1BBP13224 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GP1BBP13224 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GP1BBP13224 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GP1BBP13224 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GP1BBP13224 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GP1BBP13224 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GP1BBP13224 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GP1BBP13224 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GP1BBP13224 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms