Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COX6A1P12074 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX6A1P12074 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX6A1P12074 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX6A1P12074 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COX6A1P12074 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX6A1P12074 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX6A1P12074 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX6A1P12074 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
COX6A1P12074 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COX6A1P12074 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COX6A1P12074 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX6A1P12074 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COX6A1P12074 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
COX6A1P12074 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COX6A1P12074 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COX6A1P12074 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COX6A1P12074 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COX6A1P12074 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX6A1P12074 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX6A1P12074 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COX6A1P12074 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX6A1P12074 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COX6A1P12074 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COX6A1P12074 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX6A1P12074 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COX6A1P12074 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX6A1P12074 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX6A1P12074 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX6A1P12074 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
COX6A1P12074 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COX6A1P12074 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX6A1P12074 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COX6A1P12074 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COX6A1P12074 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COX6A1P12074 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms